AGU补充材料里引用了方法论文，参考文献能只放补充文件吗？

一份投稿AGU期刊的补充材料介绍数据处理算法，引用了两篇方法论文。作者在补充文件末尾单列了参考文献，主文只说“方法见补充材料”。AGU的正文与图件要求指出，文字、图表和补充材料中引用的所有来源应出现在主文参考文献中；补充材料不另列独立的参考文献表。否则读者和索引系统可能找不到方法依据。

逐条对照三处位置

先在补充材料标出每处引文、数据集和软件引用，再与主文参考文献表核对作者、年份、题名、版本和标识。对补充材料里独有的来源，在主文安排适当的引述或指引，并把完整条目列入统一参考文献表。不是在主文最后直接追加一串无人引用的文献；读者应知道哪一步处理用到了它。若同一来源正文和补充材料都引用，保持同一个编号或作者年份口径。

例如正文图三由一个公开算法生成，算法细节只在补充方法中交代。正文方法段可以简要说明采用何方法并指向补充材料的具体节，主文参考文献列出原始方法和所用软件版本。若引用的是数据集，还需核对AGU开放研究声明里的数据位置、版本与参考文献是否一致。只把仓储链接贴在补充材料中，无法替代正式的数据引用。

有些补充材料是表格或视频说明，作者容易以为里面的资料不算“正文引用”。实际上，只要支撑所报告的研究处理，来源仍应纳入统一核对。可以先按“补充图一、表二、方法三”列出所有外部依据，再回到主文寻找相应研究步骤。对于只出现在补充图注中的商业软件手册或数据库说明，检查它是否可公开检索、版本是否明确；若来源不可取得，别用一条含糊的私人文件名充当参考文献。最终检查主文参考文献条目是否真正对应所用版本。补充材料的参考依据也应随主稿版本变更同步核验，避免修订时漏掉关键引文和所用数据集。

检查提交文件是否能被独立阅读

补充图和表要有清楚编号与图注，主文提及它们时使用相同称呼。修改参考文献顺序后，重新生成主文与补充材料的交叉引用，尤其是自动编号可能变化的稿件。提交前打开系统转换出的审稿PDF，确认补充文件确已附上，且主文中的“见补充图”能找到对应文件。

这项整理不是为排版漂亮，而是让重要方法与数据依据可被发现和核验。参考文献统一收在主文，补充材料仍需把步骤写清，两者各司其职。