投稿准备 · 2026/10/21
组织切片只拍代表性视野,定量抽样怎样交代?
预设切片和视野抽样规则,区分展示图与定量数据,并按动物层级说明独立样本数。
论文配一张漂亮的组织切片图,再说“每只动物取五个视野定量”。如果五个视野是操作者看到信号最强的地方才拍下,平均值不能代表整张切片;如果把五个视野当五只动物计入统计,又会夸大独立样本数。投稿时要分别交代展示图如何选、定量视野如何抽、最终n是什么。
在拍照前确定抽样规则
方法段写明每只动物取多少块组织、每块多少张切片、切片间距、目标解剖区域如何定义。视野可以按预设网格、随机坐标或系统抽样选择,但要写清起点、倍率、每张切片的视野数量和不可用视野的排除条件。若区域需要人工圈定,说明谁圈、是否知道分组,是否由第二人核对。所谓“代表性图片”可用于直观展示,但应解释它来自哪一组、如何从已量化的图像中选出,不能用展示图代替完整样本的统计。
自拟例子中,每组四只动物,每只取三张切片,每张取五个视野,总共每组60个视野。若处理是按动物分配,独立实验单位仍是四只;可先在动物内汇总各视野结果再做组间分析,或使用考虑层级的模型。在动物是处理分配单位时,把60个视野直接当成60个互不相关的n,会让误差估计看起来过小。若某只动物有一张切片破损,记录剩余视野数量和预设处理规则,不要悄悄用另一只动物的额外视野补上。
让图像和数值能够互相追溯
保留原始全视野图、切片与动物编号、采集日期和图像分析参数。还应记录照片是否经过裁剪、旋转或对比度调整,确保展示图可追溯到原始文件。阈值、背景扣除或阳性细胞计数规则应在方法中交代,尤其要说明是否对两组统一应用。若图中展示的视野不是按定量抽样规则获得,图注要明确“用于展示”的选择依据。结果图应说明每个点代表动物平均值、切片平均值还是单个视野;若多层数据都画出,应避免读者误把密集点群当作大量独立动物。
ARRIVE 2.0要求说明实验单位、样本量、随机化、盲法和分析方法。显微镜实验设计的原始方法论文进一步建议在采集前确定视野跳过和特征选择标准,并报告足以复现的图像采集过程。这些资料不是说每个实验都必须固定“五个视野”,而是要求抽样规则与结论范围一致。
投稿前从定量表抽查一只动物,追踪三张切片和十五个视野是否都能找到原图。每组60个视野可以展示测量细节;图注仍应写明它们来自四只动物。
参考信息:ARRIVE 2.0动物研究报告指南;显微镜实验设计与偏倚控制原始方法论文。