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SCI投稿准备 · 2026/10/22

冷冻电镜复合图投稿,怎样存档共识图与局部精修图?

分清冷冻电镜复合图、共识图和局部精修图,按EMDB指南建立相互关联的记录。

一张冷冻电镜“复合图”把几个局部精修结果拼在一起,往往比单次全局精修更容易展示复合体各部分。但投稿不能只交拼合后的展示图:读者还需要知道每块密度从哪张局部图来,以及未经局部聚焦的整体结果是什么。EMDB要求把复合图、共识图和局部精修图分别登记,再通过关联信息把它们连起来。

三类图各回答一个问题

复合图用于展示多个局部精修区域合成后的整体;共识图来自未针对局部区域聚焦的全局精修;局部精修图则显示某个区域单独优化后的密度。它们的作用不同;若报告分辨率,必须说明数字属于哪张图,不能把局部精修的结果直接写成整张复合图的分辨率。准备投稿图时,在图注标出哪一幅是复合图,局部放大图来自哪个精修结果;方法段写出局部区域如何选取、对齐和合成。若同一个原子模型拟合在复合图上,还要核对它与相应地图是否位于同一坐标系。

EMDB指南要求复合图、共识图以及每张局部精修图分别建立记录,并在相关记录间填好关联。实际整理时,先列出各图的内部文件名、研究中使用的名称及预期的EMDB记录,再逐一确认。只把局部精修图当作复合图的“额外地图”上传,读者就难以分别查看各部分的验证信息。

半图别跨记录放错位置

指南列出的文件表中,复合图记录需要主图和展示图;复合半图可选,但若提供,应是真正对应复合图的半图。共识图和各局部精修图的记录则各自需要对应半图及展示图。不能把局部精修产生的半图随意标成复合图半图,也不能把不同局部图的两张半图拼成一对。FSC曲线若提供,也应与其记录中的半图及主图相符。

自拟情境里,一个复合体的左、右两部分分别作局部精修。团队有一张拼合后的全图、一张全局精修图和两张局部图。投稿前应画一张内部对应表:论文图1使用拼合全图,图2左框使用左侧局部图,图2右框使用右侧局部图;四张图各有存档记录,并用关联字段串起来。若图2右框后来换成新版精修,不能只换论文图片,还应核对对应半图、图注和记录中的关联。

提交顺序与稿件信息同步

EMDB建议先创建复合图记录但暂不最终提交,再创建共识图和各局部精修记录,之后填写相关条目的标识并完成提交。先创建复合图记录,可以汇总共同元数据;等其他记录有了标识,再把它们与复合图连起来。正式投稿前,打开每条记录核对主图、半图、展示图和关联标识;摘要或结果中出现的分辨率,应说明对应哪一张图及计算方法。复合图让展示更直观,但不能替代共识图与局部精修数据各自承担的验证任务。

参考信息:EMDB《Composite Map Deposition Guide》与《Policies》。