冷冻电镜FSC曲线报告分辨率，怎样注明口径？

“分辨率为3.2 Å”看似是冷冻电镜论文里最直接的结果，读者却需要知道这个数从哪条曲线读出。FSC是比较两张独立重建的半图在不同空间频率上有多相似的曲线；在指定阈值上读取曲线交点，再由对应空间频率换算整体分辨率。投稿时只给一个数，而不说明半图、遮罩和阈值，别人很难判断它与存档验证结果是否在比较同一件事。

把“哪条曲线”写在数字旁边

方法段先交代用于计算的两张半图来自哪一轮精修，是否采用遮罩，使用什么软件及版本，报告哪一种阈值。常见的0.143阈值可以写明，但不宜只写“按标准阈值计算”，因为验证页面还可能同时展示0.5和half-bit等参考线。图注给出曲线类型和阈值，结果段再报相应的数值与单位。若展示了遮罩前、遮罩后以及校正后的曲线，图例要分别命名，不能让三条线都叫“FSC”。

这里需要的是标清计算口径，并非多画几条线。EMDB的验证分析会从存档的两张半图计算FSC，并把作者提供的曲线或分辨率与计算值并列展示；页面区分未遮罩、遮罩、校正等结果。如果论文和验证页出现两个数字，先比较半图、遮罩与计算口径，不能只看数字大小就断言有一方错误。作者报告的数字应该能从本人的处理记录和投稿图中追溯。

遮罩会影响读数，不能藏在方法之外

遮罩用于限定计算范围，但不同遮罩处理会改变FSC的形状或数值。若曲线使用了遮罩或相位随机化等校正，方法段应交代依据；只在图例标“masked”，却不交代处理方式，别人仍无法复现计算。EMDB要求提交用于单颗粒分析等适用情形的未过滤、未遮罩半图。存档半图与计算时另行使用的遮罩是不同文件，不能把遮罩后的图当作原始半图上传。

自拟情境中，某份示例稿把论文里的3.2 Å写成“最终分辨率”，存档页面却列出未遮罩3.8 Å、校正后3.3 Å。单看差距并不能判断作者夸大，因为展示的计算方法可能不同。可操作的做法是找到论文图例与原始处理日志，确认3.2 Å是哪两张半图、哪种遮罩及哪条阈值线读得，再核对存档文件是否匹配。若仍无法对应，就要重新核算并整理曲线与说明，不能挑一个更接近验证页面的数字悄悄替换。

不让整体分辨率替代局部判断

FSC主要提供整张地图层面的相似度信息。即使一个整体数值看起来不错，结构的柔性区域也可能密度较弱，模型在该处的解释还需查看局部地图与模型拟合。反过来，作者与EMDB计算值略有差异，也不等于整篇结构结论失效；应先比较曲线的输入、遮罩和阈值。投稿前把图中数值、方法、存档的半图及验证页面逐项对照，能让差异有可核查的解释。

参考信息：EMDB《Validation analysis help》与《Policies》；wwPDB《EM validation report user guide》。