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图表数据投稿 · 2026/10/24

The EMBO Journal的EV图与Appendix源数据,为什么要另建分组ZIP

按期刊规则将扩展图、附录表的源数据按对应图表分目录并以指定包名上传。

研究团队给主文图整理了源数据,Expanded View图和Appendix表却只上传排版后的PDF,认为补充材料不需要再追原始数据。The EMBO Journal指南要求这些扩展材料的Source Data也能对应到具体项目:为Expanded View图、Appendix内容和独立文件提供一个名为“Source Data for Expanded View and Appendix”的ZIP包,内部按相关图或表分文件夹。这样读者下载后能从图表编号找到背后数值,而不是面对一堆无名文件。

先建立图表索引

列出Figure EV1、Appendix Figure S1、Appendix Table S1以及独立Dataset EV1等项目,各行注明主文件、源数据文件与处理说明。分目录时用与稿件一致的编号,文件名不必塞满实验描述,但必须让未参与项目的人认出它属于哪个图板。若一份原始数据支持两个扩展图,可在两个目录中的README交代共享关系,避免简单复制后形成不一致的两份版本。最好指定一个唯一原件及其校验值,其他目录只给引用说明;这样修订原始文件时不会遗留另一份过期副本。若扩展图由同一张显微照片的不同通道组成,文件夹应保存可辨认通道的原始文件和组合方式,而不是只放一张合成彩色图。若Appendix中的表来自几个批次合并,提供各批次标识和合并规则。对一个数据文件只用于图板的一部分时,在README写清列或行的选择条件,避免读者用整表重算出不同值。文件数量较多时可加顶层索引,记录每个子目录、图号和负责人。还要在上传前排查压缩包内部路径是否过长、是否混有系统自动生成的隐藏文件;解压后每个文件应能独立打开。若包里有代码,保留运行环境说明,别仅凭一个脚本名要求读者猜软件版本。主文图的源数据包与扩展材料包要分清,别把文件放错入口。

源数据应保留可重算的观测值、测量单位、组别和必要元数据。扩展图若是代表性电泳图,目录中可放未裁剪扫描和泳道对应表;若是复杂表,提供可编辑数据与字段说明。Appendix只是阅读位置,不是降低数据完整性的理由。若文件夹里只有从PDF截图导出的图片,读者仍无法检查原始强度或处理步骤。涉及受限信息时按许可处理,不能把受试者身份或私有密钥随ZIP打包。

重命名后做一次逆向查找

修订稿常会移动一张图的类别或编号。每次调整后,先改正文引用和图注,再改对应源数据目录及索引,最后重新压缩。解压本轮拟上传ZIP,从任意图表编号能否在两步内找到对应数值?再从文件夹反查是否有稿件中不存在的旧图。系统上传成功后,预览附件名称与类别,确认没有把主图Source Data与扩展材料Source Data混成一个模糊附件。

若从Figure EV2找不到相应原始文件,就修目录与索引后再上传。