SCI投稿准备 · 2026/10/22
物种出现记录的basisOfRecord,混合数据怎样筛选?
混合物种出现记录应按证据类型和研究目的设纳入规则,复核basisOfRecord原始值并分层报告。
一份物种出现记录下载表同时含有腊叶标本、调查员目击和自动设备识别。研究者若只按物种名、坐标筛选,表面上得到统一的分布点,实际混合了不同证据:有的能回到馆藏标本复查,有的依赖观察日志,有的来自设备与识别流程。投稿时的关键不是把类型名称排成清单,而是说明哪些证据足以回答本研究的问题。
Darwin Core的basisOfRecord描述记录所依据的材料或观察类型。GBIF常见值包括PreservedSpecimen、HumanObservation和MachineObservation等。它说明证据类别,却不自动证明鉴定或定位可靠,也不保证各发布者填得完全一致。GBIF培训材料特别提醒:这个字段虽然有用,仍需查看原始记录和数据集说明。方法段不能写成“筛选basisOfRecord后得到高质量数据”,而要写具体保留了哪些值、复核了什么。
先想清论文准备对哪段时间、哪类证据下结论,再决定纳入范围。若讨论历史分布,馆藏标本的采集日期与地点有价值,但要检查标签转录、年代和坐标不确定度;若分析近年的季节活动,长期自动设备记录可能更贴近问题,仍须核对设备工作时段与识别标准。人工观察可以提供丰富信息,但常受观察者选择地点和时间的影响。三类资料可以合用,也可以分层分析;选择必须由证据性质和研究目的解释,不能由某一类数量最多来决定。
接着做一张交叉核查表:原始basisOfRecord值、GBIF解释后的值、发布数据集、证据附件、鉴定方式以及是否有馆藏编号。挑选每一类的少量记录回到来源页面,看看“设备观察”是否真有音频或影像,“保存标本”是否能追到馆藏,空值是否被数据集统一设定。若原始与解释后字段不同,保留两个版本并说明采用哪个做筛选。不要用一条规则把空值都推断为人工观察。
同一地点的多种记录也不能简单叠加为独立重复。标本可能在另一个数据库再发布,人工观察可能引用同一张照片,设备记录可能由一段连续影像拆成多个事件。这里应结合标识符、日期、来源和采样事件核对;确证同源再去重。上一篇关于occurrenceID的处理关注的是记录映射,本篇关注证据类型的纳入边界,两步可在流程图里分别写明。
结果表至少列出每种basisOfRecord的原始条数、质控后条数和最终纳入条数;地图或模型若合并展示,图注标明混合来源。比较不同类型的时空覆盖,检查某类记录是否只集中在城市或交通沿线。若某类一排除,分布边界明显移动,应报告这个敏感性结果,而不是将变化归为物种真实范围的改变。出现记录的多少还受采集努力影响,不能从记录数直接推出种群丰度。
投稿材料中保存下载日期、查询条件、下载DOI和类型映射脚本。方法段写清“按解释后的basisOfRecord保留哪些类别,再人工核查何种异常”,附表列出改判或排除的数量。这样编辑和读者能重现的是证据选择过程,而不只是一个看似干净的最终坐标文件。