Journal of Medicinal Chemistry 投稿时，SMILES表格要怎样准备？

Journal of Medicinal Chemistry 要求作者为论文讨论的分子提供可机读的 SMILES 字符串，并把相关生化与生物活性数据一并整理成表格。这个要求的目的，是让读者和编辑能按结构检索、核对化合物与结果的对应关系；它不是把结构图从正文删掉，也不能代替结构鉴定证据。指南说明，一些分子例如抗体、超过六个氨基酸的肽和蛋白质不符合此类字符串的本意，可获豁免，具体配体是否豁免由编辑判断。

先把稿件涉及的化合物列成清单，再生成字符串。把正文表格、图示、实验部分和补充材料中讨论的每个小分子按文稿编号汇总，尤其留意同一母体结构的不同盐型、立体异构体及衍生物。将绘图软件生成的结构与 SMILES 逐一核对，不要只依靠化合物名称批量转换；名称中的位点或立体描述稍有歧义，字符串就可能指向另一分子。若一篇稿件有多个系列，清单中的编号必须和活性表、谱图及合成路线对得上。

结构字段和活性字段一起核对

期刊提供表格模板，要求在可机读结构旁列出与之相关的基本数据。整理时应让每一行代表一个明确的化合物，记录正文所用编号、SMILES、对应测定值及单位。若同一化合物在两种实验条件下有不同结果，应把条件注明，避免只留下一个看似精确的数字。若测量值低于检出限，按照原始记录表示为区间或界限，不要为了填满表格改写为虚构的点值。

提交前做一次双向检查：从正文表格任取一个化合物，能在 CSV 找到对应结构和活性；从 CSV 任取一行，也能返回文稿里的化合物编号和实验说明。若表格中出现正文完全没有讨论的结构，应判断它属于真实研究数据还是误贴的工作底稿。表格不应承担正文从未解释的大量新结论。

JMC 指南说，最终 CSV 要在投稿时作为 Supporting Information for Publication 上传。文件类型和用途不要误选成只供编辑审阅的附件，否则发表后读者可能看不到用于检索的结构数据。指南同时强调某些分子豁免，但作者不能仅凭“分子很复杂”自行空掉所有结构字段；可在提交材料中说明类型及理由，让编辑判断。

最后用文本查看器打开保存后的 CSV，检查列分隔符、引号和非英文字符是否错位。表格软件显示正常不代表上传后仍可读。若软件把长结构字符串自动转成科学计数法或截断，应回到原始结构文件重新导出，不能手工补几个字符后直接交稿。把生成结构的版本、人工核对记录和最终 CSV 保存在本地，后续若文稿编号改动，只需按清单重新对应，避免改了正文表号却忘记更新可机读附件。