SCI投稿准备 · 2026/10/26
人类生物样本投Nature,BRISQ Tier 1该怎样核对?
沿样本的采集、处理和保存过程核对BRISQ Tier 1,说明缺失信息如何影响稿件解释。
投 Nature 的研究若使用人来源血液或组织,Methods 应说清样本从哪里来,怎样取得、处理和保存。Nature 初投说明建议参照 BRISQ(生物样本报告建议),至少提供与研究相关的 Tier 1 信息。“收集临床样本并冷冻保存”遗漏了会影响测量结果的前分析过程。BRISQ 帮助读者判断样本之间能否合理比较,不要求每项研究机械填满同一张表。
先沿样本的实际经历梳理记录
可以从样本类型和采集部位写起:是血清、血浆、全血,还是某器官的组织?同为“血样”,不同制备方法会得到不同材料。然后把研究相关的患者状态和诊断依据写清;若这些因素影响研究问题,还要说明是在治疗前还是治疗后、从原发部位还是转移部位取材。并非每项都适用于每项研究;例如研究并未涉及病理组织时,不必硬填病理诊断。关键是让读者知道哪些差异可能改变分析结果。
接下来追踪采集机制、稳定化与保存。对于组织,记录活检或手术取得后如何处理,是否固定、采用何种保存方式;对于液体样本,说明采血或其他采集方式、分离过程和长期保存条件。不要把“按标准流程处理”当成完整方法,因为这个说法并未指出本研究真正采用的步骤。若样本来自既有样本库,作者应根据该库的记录核实每个可获得字段,而不是把库内所有样本假定为完全一致。
BRISQ 原始建议把项目按重要程度分为三层。Tier 1 是已知且适用时建议报告的信息,除样本类型、部位、疾病或临床信息,还包括采集、稳定化、保存等环节。某项 Tier 2 信息若正是本研究的关键变量,也不能因为它不在 Tier 1 就略去。例如比较两种富集方法的研究,富集步骤本身就需要足够细的描述。反过来,和研究结论无关的冗长仓储清单也不必塞入正文。
缺失的前分析信息怎样写
旧样本可能只留下“入库年份”,找不到采集到固定之间的时间。此时不能根据同一医院的常规流程反推每份样本的具体时间。先区分“已核实”“仅有中心常规记录”“未知”,再判断缺失字段是否会影响本研究的比较。如果两组样本的来源或处理批次不同,而固定时间又未知,应在方法和局限中交代这种不确定性,必要时限制可作出的结论。BRISQ 原文也说明,未知 Tier 1 项目并非自动导致研究不可发表,关键在于结合研究情境说明影响。
投稿前可拿一份样本从采集记录走到分析数据:样本编号能否对应类型、来源、处理批次和保存状态;Methods 中写的范围是否与实际纳入样本一致;结果中比较的组别是否经历了不同流程。涉及个人隐私的身份资料不应为了“完整”而公开,报告的是足以解释研究质量的样本特征和过程。这样准备的 Tier 1 信息,比单独附一份空泛的检查表更能帮助编辑和读者核对研究。