PLOS ONE注册报告的Protocol，数据已收完还能投稿吗？

PLOS ONE 的 Registered Report Protocol 是在研究实施前接受评议的方案稿。若研究需要专门招募参与者，或为该研究采集、修改、处理数据，这些步骤应在方案被接受发表之后进行。期刊允许在必要时纳入少量初步或试点数据，用于证明研究可行性或原理，但不能把主体研究做完再把结果隐去、伪装成事前方案。若试点样本后来可能进入正式分析，应在方案里预先说明是否纳入以及避免重复使用的办法。已经完成主要数据收集的作者，应重新判断是否适合普通研究论文。

准备 Protocol 时，先把研究问题与主要预测写成可检验的句子，再列出对象、入排标准、样本量依据、测量办法和分析计划。期刊要求方法细节足以让别人复制或重复研究，并确认研究完成后数据将按 PLOS 数据政策提供。若研究涉及伦理审批或豁免，也应在方案阶段交代。不是把实验流程写得很长就算充分，关键是未来结果无论方向如何，读者都能知道原先准备怎样判断。

试点数据与正式数据要分开

试点数据可帮助确认招募可行、测量工具能正常运行，但其任务不能提前回答主要假说。若作者已经用试点结果挑过最显著的终点，应说明这种选择如何影响后续主研究设计，避免把有利结果当成未受数据影响的预设方案。方法中标清哪些参数来自先前文献，哪些来自试点估计，并说明可能的不确定性。

不同研究类型还有额外指引。系统综述的方案应参考 PRISMA-P，临床试验方案应参考 SPIRIT；期刊也提供方案模板，但模板不能替代本研究的具体操作。若实验会在登记后修改，应记录版本、时间和原因，使正式结果论文能区分原定分析与后续探索。

完成研究后，Registered Report Research Article 要报告所有预先规划的分析，偏离方案时要具体说明并给理由；也允许另列探索性、未规划分析。不能只提交得到阳性结果的部分，或把后期分析重新命名为预注册主分析。方案与结果的对应表可在本地从第一天就维护。

投稿前检查时序证据：伦理批准、招募、数据提取、方案提交和接受的日期是否对应？若团队已经启动了主体研究，应坦诚选择其他合适稿型。问题和分析要在正式研究前确定；已完成的数据不能事后包装成注册报告。若团队已有历史数据库，需说明本研究是否会重新提取或处理数据，何时开始使用它们，不能因为数据原本存在就认为所有分析都可先完成。方法计划还应规定主要终点和排除规则，让后续结果可以与事前版本逐项比较。