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SCI投稿材料 · 2026/10/17

测序数据还没有登录号,期刊投稿前怎么安排?

分清数据库提交、登录号与公开时间;按目标期刊要求把编号写进稿件和数据声明。

测序数据的 accession number 是数据库给一条提交记录的识别号,不是论文 DOI,也不是把原始文件放在电脑里的文件名。若研究结论依赖可共享的序列数据,投稿前应先读期刊的数据政策,确认需要存到哪个数据库、提交到什么程度,以及稿件何处列出编号。PLOS Genetics 的投稿指南要求适用数据集放入合适的公共存储库,并在数据可用性声明中给出登录号;正文提到该数据集时,也应提供编号或 DOI。

先界定要提交的究竟是哪批数据

研究中可能同时有原始读段、组装后的序列和分析表格,它们不一定进同一个库,也不一定拿到同一种编号。把稿件中的数据描述与实验记录对应起来:样本或物种、数据类型、版本、文件数量及论文图表所依据的分析结果。若文中说分析了十份样本,而提交记录只有其中一部分,编辑和读者会无法确认哪些结果可复查。

随后按数据库要求提交。以核酸序列为例,NCBI GenBank 有专门的提交流程;若是测序原始读段,还要查看适合的原始读段库。不能因为都与“基因”有关就随便选一个库。填写元数据时保持样本标识、物种名称和稿件用语一致,存储库退回修改时应先处理,不要把尚未确认的编号写进论文。

编号写在哪里,什么时候必须有

拿到正式登录号后,先在数据可用性声明中写清库名、编号和开放时间;正文第一次讨论这批数据或相应方法时,也给出识别号。若库提供版本号,核对稿件引用的版本是否与实际分析一致。不要把私下上传后的临时号冒充已生效的公开记录,更不要随意编造一个看起来像数据库编号的字符串。

不同期刊对于编号出现的时点有区别。PLOS Genetics 写明,多数情况下应在完整投稿时提供;确实不能在接收前获得的少数情况,至少须在接收时给出。这个例外不是“所有数据都可以发表后再存”。目标刊若有更细要求,应遵守其具体数据政策。作者也可在数据库允许的情况下安排公开时间,但应确认编辑和评审所需的访问方式,避免稿件说“可获取”而记录实际仍不可读。

若数据库为记录设置暂缓公开日期,要分清“数据库已受理”与“读者现在能访问”。给评审使用的私人访问方式,也不等于论文上线后所有读者都能取得数据。把开放日期和访问条件写成实际状态,避免在系统表单里勾选公开,而对应记录仍处于限制状态。

提交前最后比较三处信息:数据库记录里的数据集、稿件正文中的样本和编号、系统表单中的数据声明。三处对应,读者才知道论文的哪个结论由哪个数据集支持。若数据因伦理或法律限制不能公开,改按期刊的受限共享政策说明,不应为取得登录号而上传不该公开的材料。